在天然環境下，氨氮廢物會被水生植物或微細藻類當做營養源吸收，或是在充足氧氣的情形下利用硝化作用將氨先後轉換為亞硝酸鹽及硝酸鹽，最後再透過脫氮作用轉換為氮氣排出至大氣中。但人工養殖環境下，養殖戶為了追求收益與快速成長，因此常放養高密度的養殖物種且投餵大量飼料，若產生高濃度亞硝酸鹽及硝酸鹽卻未及時處理，則會從鰓部進入生物體內，導致養殖生物中毒後食慾下降，鰓部腫脹、增生，出現黑鰓或黃鰓，鰓絲呈暗紅色，伴隨缺氧騷動不安或反應遲鈍，經常上水面呼吸等症狀，且最後恐導致大量死亡。室內循環水養殖系統需仰賴生物過濾進行氨氮廢棄物的分解，了解系統硝化菌的運作和如何掌控硝化菌的繁衍和氨氮分解狀況，常左右了系統建立的成敗。
溫帶地區淡水養殖池的池塘管理中，當水溫開始升高後常伴隨亞硝酸鹽含量增加，因為將氨轉化為亞硝酸鹽的細菌比將亞硝酸鹽轉化為硝酸鹽的細菌更早「甦醒」；因此，溫帶地區初春時期常發生淡水養殖池中因亞硝酸濃度升高導致褐血的症狀，此時雖然不致死但也會讓魚隻衰弱；為了改善養殖戶會在水中加入鹽，其目的是靠滲透壓的原理，降低魚類再通過鰓吸收過多亞硝酸鹽進入血液。因此越冬後的初春，應隨時注意池中亞硝酸鹽的變化，當發生褐血症狀時，使用鹽進行調節並同時提升水中溶氧量；但鹽的使用也必須小心警慎，每一種養殖淡水魚類對鹽份的耐受度都不同，以便免造成大量的損失。
《產業發展中心 產業分析組 林智焜摘譯》
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